L'esofagite cronica, di norma, si sviluppa da un'esofagite acuta e si basa praticamente sugli stessi fattori eziologici. Può essere caratterizzata dalla formazione di ulcere che non guariscono, dalla comparsa di processi infiammatori a lungo termine con stenosi cicatriziale e da tumori. L'esofagite cronica può essere sia aspecifica che specifica (tubercolosi, sifilide, actinomicosi).